В южной апсиде находилась круглая в плане крещальная купель диаметром 1,6 м со сливом в центре, как и купель в базилики Леснянская I, эта купель была обработана гидрофобным раствором. Более того, в верхнем ряду кладки отсутствовала камни согласно расположению сторон света, тем самым образовывалось изображение креста.